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TotalSeq™製品を使用した新しい研究

次のリストには、TotalSeq™製品を使用したいくつかの文献とCITE-seq (Stoeckius et al.)およびREAP-seq (Peterson et al.)の論文が含まれています。bioRxivとmedRxivの原稿は査読前であることにご注意ください。

注目の文献

Single-cell profiling of myeloid cells in glioblastoma across species and disease stage reveals macrophage competition and specialization.

Pombo Antunes AR, et al. Nat Neurosci. March 2021.

この論文の著者は、マウスおよびヒトの神経膠芽腫における骨髄系細胞の状況を解明するためにCITE-seqを利用しました。この研究により、病期全体にわたって動的な、種間で保存された樹状細胞およびマクロファージの細胞集団が明らかになりました。

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Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19.

Stephenson E, et al. Nat Medicine. April 2021.

この論文の著者は、TotalSeq™-C抗体パネルを用いて様々な重症度のCOVID-19患者における細胞表面タンパク質のプロテオーム解析やTCR、BCRの解析を行いました。この研究は協調的な免疫応答について説明し、また治療のための新たな知見を提供するものであるといえます。

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A conserved dendritic-cell regulatory program limits antitumour immunity.

Maier B, et al. Nature. 2020.

この研究は、PD-L1阻害後の抗腫瘍T細胞免疫について理解することを目的としています。1細胞マルチオミクスを用いて、抗腫瘍活性を制限しIL-4の発現によって誘導される、樹状細胞の調節プログラムが特定されました。

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すべての文献

Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells.
Mimitou EP, et al. Nat Biotech. June 2021.
Integrated analysis of multimodal single-cell data.
Hao Y, et al. Cell. May 2021.
Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19.
Stephenson E, et al. Nat Medicine. April 2021.

Characterizing the molecular regulation of inhibitory immune checkpoints with multimodal single-cell screens.
Papalexi E, et al. Nat Genetics. March 2021.
Single-cell profiling of myeloid cells in glioblastoma across species and disease stage reveals macrophage competition and specialization.
Pombo Antunes AR, et al. Nat Neurosci. March 2021.
Maturation and persistence of the anti-SARS-CoV-2 memory B cell response.
Sokal A, et al. Cell. March 2021.

Simultaneous single cell measurements of intranuclear proteins and gene expression.
Chung H, et al. bioRxiv. Jan 2021.
Multi-modal Single-Cell Analysis Reveals Brain Immune Landscape Plasticity during Aging and Gut Microbiota Dysbiosis.
Golomb S, et al. Cell. Dec 2020.
TEA-seq: a trimodal assay for integrated single cell measurement of transcription, epitopes, and chromatin accessibility.
Swanson E, et al. bioRxiv. Nov 2020.
Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19.
Su Y, et al. Cell. Oct 2020
Single-Cell Omics Reveals Dyssynchrony of the Innate and Adapative Immune System in Progressive COVID-19.
Unterman A, et al. medRxiv. July 2020
Mouse models of neutropenia reveal progenitor stage-specific defects.
Muench DE, et al. Nature. June 2020.
T cell-inducing vaccine durably prevents mucosal SHIV infection even with lower neutralizing antibody titers.
Arunachalam P, et al. Nat Med. 2020.
A conserved dendritic-cell regulatory program limits antitumour immunity.
Maier B, et al. Nature. 2020.
Multi-omic single cell analysis resolves novel stromal cell populations in healthy and diseased human tendon.
Kendal et al. Scientific Reports. Sept 2020.

Single cell transcriptomics reveals opioid usage evokes widespread suppression of antiviral gene program.
Karagiannis et al. Nat Comm. May 2020.
Broad immune activation underlies shared set point signatures for vaccine responsiveness in healthy individuals and disease activity in patients with lupus.
Kotliarov et al. Nat Med. Feb 2020.
Normalizing and denoising protein expression data from droplet-based single cell profiling.
Mulè M, et al. bioRxiv. 2020.
Single-cell analysis reveals fibroblast heterogeneity and myofibroblasts in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease.
Valenzi EM, et al. Annals of the Rheumatic Diseases 2019.
Single-cell multiomic analysis identifies regulatory programs in mixed-phenotype acute leukemia.
Granja et al. Nat Biotechnol. Dec 2019.
Nuclei multiplexing with barcoded antibodies for single-nucleus genomics.
Gaublomme et al. Nat Communications. July 2019.
Simultaneous epitope and transcriptome measurement in single cells.
Stoeckius et al. Nat Methods. Sept 2017.
Multiplexed quantification of proteins and transcripts in single cells.
Peterson et al. Nat Biotechnol. Oct 2017.

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TotalSeq™の実際：動画プロトコルとセミナー

Using TotalSeq™ Antibodies for CITE-Seq

細胞表面染色やGEMの作製、バーコード付加など、TotalSeq™抗体を用いたCITE-seqのワークフローについて見てみましょう。

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Overview of the TotalSeq™ Workflow

TotalSeq™製品はCITE-seqのワークフローに円滑に統合できるよう設計されており、10xGenomics社の装置などの液滴ベースの1細胞シーケンシング用プラットフォームに対応しています。

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Introduction to Single Cell Proteogenomics Applications using TotalSeq™ Antibodies

TotalSeq™製品を使ってCITE-seqを行うことで、同一細胞のタンパク質と転写産物を同時に検出できます。

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技術情報

シーケンシングワークフローにおけるTotalSeq™試薬使用方法の概要について、プロテオゲノミクス用プロトコルリストをご覧ください。

どのTotalSeq™試薬を選べばいいのかお悩みですか？よくあるお問い合わせをご覧いただくか、テクニカルサービスチームにお問い合わせください。

すべてのプロトコルを見る >

アプリケーションノートとeBook

アプリケーションノート: Correlated Expression of Protein and RNA Using Bulk and Single-Cell Proteogenomics

BEN-seqの有用性と、刺激した細胞と未刺激細胞において、どのように280種類のタンパク質を検出し、Th1応答を検出する手法が使われたのか見てみましょう。

アプリケーションノートのダウンロード >

Ebook: The Evolution and Future of Single-Cell Proteogenomics

TotalSeq™を使用するアプリケーションの詳細と、それらが精密腫瘍学における発見にどのように貢献できるのか学びましょう。

Ebookのダウンロード >

ブログ

Tips and Tricks for Titrating TotalSeq™ Antibodies

CITE-seqのようなシーケンシングアプリケーションで最適な結果を得るには、TotalSeq™抗体の条件検討が重要です。このブログでは、抗体のタイトレーションの重要性とその方法、抗体濃度の選び方について解説しています。

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Single-Cell Multiomics: A Beginner’s Guide to Understanding CITE-Seq and TotalSeq™ Reagents

マルチオミクスは従来のシーケンシング実験を大きく変え、一度の実験でこれまでにないほど多くのタンパク質と遺伝子発現の解析をできるようになりました。CITE-seqやREAP-seqのような手法の背景にある基本を学び、TotalSeq™試薬がどのようにワークフローに統合されるのか見てみましょう。

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Overview of Single-Cell Sequencing: Isolation Methods and Techniques

1細胞シーケンスがどのように生物学を新たな発見の時代へ推進させたのか、そして1細胞の分離を可能とする方法について学びましょう。

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